Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RhodP97348 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RhodP97348 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhodP97348 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhodP97348 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhodP97348 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhodP97348 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RhodP97348 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhodP97348 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhodP97348 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms