Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim43bP86448 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms