Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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