Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx3P81067 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms