Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprn2P80560 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms