Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms