Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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