Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NfixP70257 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NfixP70257 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NfixP70257 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms