Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms