Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SbdsP70122 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms