Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms