Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx1P63006 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx1P63006 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx1P63006 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx1P63006 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx1P63006 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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