Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psme3P61290 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psme3P61290 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psme3P61290 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psme3P61290 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms