Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2kP61087 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms