Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms