Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ActbP60710 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ActbP60710 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ActbP60710 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ActbP60710 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ActbP60710 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ActbP60710 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ActbP60710 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ActbP60710 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ActbP60710 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ActbP60710 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ActbP60710 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms