Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms