Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms