Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rin3P59729 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms