Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr3bP59470 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr3bP59470 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms