Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms