Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms