Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubgcp3P58854 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms