Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms