Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp25P57080 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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Usp25P57080 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Usp25P57080 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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