Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bace1P56818 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bace1P56818 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms