Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SmoP56726 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SmoP56726 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SmoP56726 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SmoP56726 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms