Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lim2P56563 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lim2P56563 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lim2P56563 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms