Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ephb3P54754 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms