Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Faf1P54731 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Faf1P54731 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Faf1P54731 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms