Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacnb3P54285 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacnb3P54285 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms