Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PctpP53808 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PctpP53808 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PctpP53808 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms