Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fgd1P52734 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms