Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr5P51682 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr5P51682 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr5P51682 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr5P51682 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccr5P51682 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms