Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms