Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TspoP50637 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TspoP50637 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TspoP50637 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TspoP50637 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TspoP50637 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TspoP50637 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TspoP50637 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TspoP50637 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms