Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxc13P50207 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc13P50207 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms