Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CitP49025 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CitP49025 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CitP49025 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CitP49025 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CitP49025 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms