Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prox1P48437 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prox1P48437 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prox1P48437 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms