Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Abcd1P48410 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms