Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx2P48379 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms