Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VdrP48281 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VdrP48281 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VdrP48281 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VdrP48281 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms