Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TgfaP48030 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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