Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13P47963 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13P47963 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms