Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CratP47934 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CratP47934 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CratP47934 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CratP47934 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CratP47934 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms