Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SrprbP47758 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms