Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stt3aP46978 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stt3aP46978 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms