Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab11bP46638 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rab11bP46638 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rab11bP46638 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rab11bP46638 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab11bP46638 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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