Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf1P46099 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms