Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sipa1P46062 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms